Sağlık ürünlerinin üretimi için tasarlanan temiz odalarda, filtre edilmiş hava içerisinde ve yüzeylerde belirli kabul kriterleri ölçüsünde canlı partikül veya mikroorganizma sayısına izin verilir. Bu ortamlarda havada asılı kalan canlı partikül sayısı, pasif ve aktif hava ölçümü yapılarak belirlenmelidir. Aktif ve pasif hava ölçümleri; toplam aerobik mezofilik bakteriler, toplam anaerobik mezofilik bakteriler, toplam küf/maya biyokontaminasyonunun izlenmesini sağlar. Ayrıca temiz oda-ekipman yüzeylerinde ve personelden kaynaklı kirlenme kapsamında mikrobiyolojik yüke bakılmalıdır. ISO 14698-1&2 standardı baz alınarak biyolojik izlem gerçekleştirilir. Temiz oda sınıflandırması her ne kadar katı partikül miktarına göre yapılıyor olsada, GMP gerekliliği olarak canlı mikroorganizma sayısı da dikkate alınmaktadır. Medikal ürün üretiminde özellikle ürün biyolojik yük miktarı limitleri, temiz oda mikrobiyolojik kabul kriterleri ile yakından ilgilidir.